Dalam rangka melaksanakan aktivitas dan mengimplementasikan Visi dan Misi Yayasan, disusunlah program kerja yang akan dilaksanakan. Adapun program kerja yang akan dilaksanakan oleh Yayasan Imam Bukhori Tulungagung yaitu :

1. Pendidikan (TK, SD, TPQ).
2. Dakwah dan Sosial (DKM Masjid Imam Bukhari, Kegiatan Sosial).
3. Ekonomi (Zakat, Infaq, Shadaqah, Serta Badan Usaha).